Les inconvénients du projet du génome humain, ou HGP, incluent le nombre de risques impliqués dans les procédures et la discrimination contre des traits spécifiques. Ce projet pose également des problèmes de moralité pour tous ceux qui reçoivent le traitement.
Les futurs parents, à un moment donné, pourraient être en mesure de choisir les traits que leurs enfants posséderont. Le tempérament et la personnalité, la stature et le type de corps peuvent tous être déterminés et jusqu'à ce que la science soit certaine des effets secondaires, des problèmes de santé peuvent survenir chez les personnes dont l'ADN a été spécifiquement séquencé. Un autre inconvénient du HGP est la possibilité qu'il soit utilisé comme un type de discrimination raciale
