Bien que le bois de noyer noir produise une toxine appelée juglone, il peut être brûlé en toute sécurité. Ce n'est pas le premier choix de la plupart des gens pour le bois de chauffage car il est cher et est principalement utilisé pour les meubles.
Beaucoup de gens sont sceptiques quant à la sécurité de la combustion du bois de noyer noir, car l'arbre lui-même produit de la juglone. Cette toxine peut être dangereuse lorsqu'elle est exposée aux plantes, aux animaux et aux enfants. Les copeaux de bois de noyer noir sont également toxiques, il faut donc faire attention lorsque des enfants ou des plantes se trouvent autour d'un feu. Une fois que la juglone entre en contact avec l'air, l'eau ou des bactéries, la toxine se dissipe. Cela le rend sûr à brûler car la toxine n'est pas transportée dans la fumée.