Les pèlerins de la colonie de Plymouth Bay étaient des calvinistes et des séparatistes puritains, tandis que les puritains de la colonie de Massachusetts Bay étaient déterminés à réformer l'Église anglicane de l'intérieur. Bien que tous deux soient protestants et puritains, ils avaient des objectifs différents et croyances.
La plupart des puritains voulaient purifier les pratiques de l'église anglicane, préférant la réformer de l'intérieur pour éliminer toutes les souillures du culte catholique. Beaucoup de ces puritains ont fondé la colonie de la baie du Massachusetts afin de construire leur ville sur une colline, une église que d'autres puritains pourraient considérer comme un modèle. Cependant, les pèlerins avaient déterminé à la fin du 16ème siècle que l'Église anglicane était au-delà de la réforme. Par conséquent, ils s'étaient entièrement séparés de l'Église, beaucoup d'entre eux s'installant en Hollande avant d'émigrer dans les colonies américaines.
Bien que ces différences semblent mineures, il était plus facile pour les puritains du Massachusetts d'obtenir un financement, l'approbation et la protection du trône britannique que pour les pèlerins. De plus, les puritains du Massachusetts étaient dans l'ensemble un groupe plus instruit et plus riche que les pèlerins, qui étaient pour la plupart des artisans et des agriculteurs. Cela a conduit, au fil du temps, à plus de prospérité et à une croissance beaucoup plus rapide pour la région de Boston-Salem. En 1691, la colonie de Plymouth, encore petite, a fusionné avec la colonie de la baie du Massachusetts pour former la province de la baie du Massachusetts.
