Pour indiquer le stress, un hamster alterne entre courir et se toiletter ainsi qu'en couinant, en mordant et en mangeant avec excès. Il devient également plus irritable, est plus susceptible de mordre et peut se confiner ou se cacher. Au fil du temps, à mesure que le stress endommage le système digestif, il peut commencer à souffrir de diarrhée ou de constipation.
Un hamster peut être facilement stressé par des changements dans son environnement. Les tâches de routine comme nettoyer sa cage ou le manipuler peuvent le bouleverser et le traumatiser, surtout s'il vient d'être déplacé et n'est pas habitué à son nouvel environnement. Pour minimiser le stress, un propriétaire doit éviter de réveiller un hamster pendant la journée et, s'il garde plusieurs hamsters, s'assurer qu'ils ne se comportent pas de manière agressive les uns envers les autres. Un hamster reste stimulé en fournissant une roue de course, des tunnels, des jouets et d'autres divertissements. La cage doit être suffisamment grande pour que le hamster se sente à l'aise ; s'il est trop petit, un hamster peut commencer à ronger les barres. Enfin, les propriétaires doivent s'assurer que la cage est placée dans une zone tempérée qui n'est pas exposée aux courants d'air ou à la lumière directe du soleil.
Lorsqu'un hamster est stressé, il devient également plus sensible aux maladies. Par exemple, un hamster récemment sevré et agité est plus susceptible de développer une queue mouillée, une maladie hautement contagieuse qui peut entraîner la mort.