Les manchots se reproduisent comme la plupart des oiseaux, avec une fécondation interne qui est réalisée en assemblant les cloaques de chaque manchot. Le mâle pulvérise du sperme dans le cloaque de la femelle où il peut ensuite voyager à l'intérieur et fertiliser les œufs.
L'œuf doit être gardé au chaud et protégé pour éclore. Le mâle surveille généralement l'œuf et reste assis dessus la plupart du temps jusqu'à son éclosion, tandis que la femelle part à la recherche de nourriture.
Différents types de manchots ont une saison de reproduction différente. La plupart des manchots se reproduisent pendant le printemps et l'été de l'Antarctique, mais certaines espèces, comme les manchots empereurs, se reproduisent de juin à août, ce qui correspond à l'hiver antarctique.
