La pollution affecte les dauphins en contaminant les sources de nourriture et en provoquant des zones mortes dépourvues de poisson et d'autres aliments de base importants dans l'alimentation des dauphins, comme l'explique le Seattle Post-Intelligencer. La contamination peut endommager le système immunitaire d'un dauphin, et les zones mortes peuvent forcer les dauphins à se déplacer vers de nouveaux habitats.
Quand un dauphin mange un organisme contaminé par certains polluants, il stocke les produits chimiques dans ses réserves de graisse et d'autres parties de son corps. Le polluant peut continuer à endommager les systèmes reproducteurs des dauphins adultes et même provoquer la naissance de veaux avec des malformations congénitales. Ces toxines peuvent également endommager le système immunitaire du dauphin, le laissant ouvert aux infections, telles que la pneumonie, qui peuvent entraîner la mort. Le corps des dauphins héberge déjà des parasites, qui peuvent devenir incontrôlables lorsque le système immunitaire d'un dauphin est compromis.
Les zones mortes peuvent se produire sans activité humaine, le National Ocean Service déclare que la pollution par les nutriments crée de nouvelles zones mortes dans des zones autrefois saines. Des proliférations d'algues peuvent se produire lorsque l'eau est exposée à un excès de ruissellement de nutriments provenant des fermes. Lorsqu'un grand nombre d'algues meurent et commencent à se décomposer, le processus épuise l'oxygène dans l'eau, ce qui entraîne une zone morte dépourvue de vie marine. Les dauphins qui prospéraient autrefois dans ces zones sont alors obligés de trouver de nouveaux habitats avec des sources de nourriture stables.