En janvier 2015, il restait environ 2 000 singes araignées du Yucatan à l'état sauvage sur la péninsule du Yucatan. Il ne reste que 300 à 400 singes araignées laineux dans le monde.
Ce sont deux des neuf espèces de singes araignées répertoriées par l'Union internationale pour la conservation de la nature (UICN).
Le singe araignée panaché ou brun (Ateles hybridus) figurait sur la liste de l'UICN des 25 primates les plus menacés au monde, 2008-2010. En 2015, l'UICN répertorie trois espèces de singes araignées en danger critique d'extinction, cinq espèces en danger et une espèce vulnérable.
Les espèces de singes-araignées sont menacées principalement en raison de la perte d'habitat due à l'agriculture et à l'exploitation forestière, car elles dépendent de vastes zones forestières pour leur survie. Ils sont également chassés comme source de nourriture pour les humains.
