Pet MD déclare que la durée de vie moyenne des carlins est de 12 à 15 ans. Les carlins souffrent parfois de méningo-encéphalite nécrosante, une maladie qui provoque une inflammation du cerveau et des méninges. Les carlins sensibles à la maladie présentent des symptômes entre 6 mois et 7 ans.
Les carlins qui souffrent de méningo-encéphalite nécrosante meurent généralement ou doivent être endormis dans les quelques mois suivant l'apparition de la maladie. Parmi les autres affections dont souffrent les carlins, citons la dysplasie canine de la hanche, le palais allongé, la luxation rotulienne, les narines sténosées et la maladie de Legg-Perthes. D'autres conditions qui affectent la race comprennent l'entropion, la kératoconjonctivite sèche, l'hémivertèbre, la démodécie et la distichiase. Certains carlins souffrent également d'obésité, d'infections cutanées, de dégénérescence nerveuse et d'allergies.
