Le principal effet de la crise de l'annulation a été d'établir la suprématie du gouvernement fédéral sur les gouvernements des États. Cela est également devenu un facteur qui a poussé les États du Sud à annuler l'Union elle-même, entraînant leur sécession et la création de la Confédération.
Thomas Jefferson et James Madison ont d'abord préconisé la doctrine de l'annulation à la fin du XVIIIe siècle. Jefferson a proposé que les États aient le droit de discerner si le gouvernement fédéral avait outrepassé ses limites et pourraient annuler toutes les lois qu'ils jugeaient inappropriées dans leurs propres juridictions. Tout en protestant contre le tarif de 1828, le vice-président John C. Calhoun, originaire de Caroline du Sud, a fait valoir que les États avaient un droit de veto sur l'application de la loi fédérale. Lorsqu'un tarif de compromis de 1832 n'a que légèrement modifié la situation, la législature de Caroline du Sud a convoqué une convention d'État et a adopté l'ordonnance d'annulation, qui a déclaré les deux tarifs nuls et non avenus pour l'État de Caroline du Sud.
Le président Andrew Jackson a répondu de manière agressive. Le Congrès a adopté le Force Bill, qui lui a permis d'envoyer des militaires pour percevoir les tarifs. Ils ont également adopté un projet de loi tarifaire de compromis, adoucissant la législature de Caroline du Sud et les obligeant à retirer l'ordonnance d'annulation. Cependant, les troubles dans les États du Sud se sont poursuivis, conduisant finalement au déclenchement de la guerre civile en 1861.
