Les geckos ont de nombreux prédateurs naturels, le principal étant les serpents. Les grandes araignées, oiseaux et autres mammifères mangent également des geckos.
Face à un prédateur potentiel, de nombreux geckos peuvent perdre leur queue. Cette auto-amputation ou autonomie aide le gecko à s'échapper car la queue détachée se tortille et distrait le prédateur, permettant au gecko de s'échapper. Dans la plupart des cas, le gecko développera une queue de remplacement faite de cartilage. Une fois le danger passé, un gecko retournera souvent à sa queue détachée et s'il est disponible, le gecko le mangera. Les geckos peuvent également échapper aux prédateurs en utilisant ses cale-pieds conçus pour grimper en douceur sur les surfaces verticales.
