Selon Forensic Fluids Laboratories, les tests de dépistage de drogues par écouvillon oral sont jusqu'à 60 % plus sensibles à la cocaïne, aux opiacés et aux méthamphétamines que les tests instantanés à base d'urine. Cela réduit considérablement le nombre de résultats faussement négatifs. Forensic Fluids Laboratories cite une étude du Journal of Analytical Toxicology, qui démontre que les tests d'urine produisent des résultats faussement négatifs jusqu'à deux fois plus souvent que les tests d'écouvillonnage buccal.
L'une des principales différences entre les deux types de tests consiste à détecter le THC, la substance chimique active de la marijuana. Forensic Fluids Laboratories rapporte que les écouvillonnages buccaux sont capables de détecter l'utilisation jusqu'à 72 heures après l'utilisation du médicament. En revanche, les tests d'urine détectent souvent le THC dans des échantillons jusqu'à 120 heures après l'utilisation de la drogue. MedicalHealthTests.com ajoute que l'efficacité des tests peut varier considérablement, car aucune certification ni aucun protocole cohérent n'est en place pour guider le processus de test.
MedicalHealthTests.com explique que le brossage, l'utilisation de la soie dentaire et la pratique de l'hygiène bucco-dentaire peuvent faire en sorte que le test d'écouvillonnage buccal génère un faux négatif. Une étude de 2006, publiée dans Clinical Biochemist Reviews, a révélé que l'ingestion d'alcool immédiatement après l'ingestion de marijuana rince temporairement la bouche et produit de faux négatifs. Les auteurs de l'étude suggèrent que l'eau peut avoir un effet similaire. Les auteurs indiquent que le test 15 à 20 minutes après un tel rinçage produit des résultats plus précis.