Bien que les avis soient partagés quant à la fiabilité du contenu du site Web WebMD, une chose est sûre : la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis estime que le contenu est solide, puisque l'agence fédérale s'est associée avec WebMD en 2008 pour fournir des informations sur la santé des consommateurs. La collaboration a impliqué la création d'une ressource sur le site Web WebMD où les consommateurs peuvent accéder directement aux informations sur les produits réglementés par la FDA et les mises à jour des consommateurs de la FDA à inclure dans "WebMD The Magazine".
De nombreux médecins font confiance aux informations de WebMD. L'enquête 2011 Wolters Kluwer Health Point-of-Care, menée par IPSOS, a montré que 42 % des médecins obtiennent fréquemment des informations pour traiter et diagnostiquer les affections chez les patients à partir de services en ligne gratuits, tels que WebMD. Au total, 34 % ont déclaré n'avoir consulté ces sources qu'occasionnellement pour obtenir des informations sur la santé.
Il y a cependant ceux qui ont des opinions divergentes. En 2011, un article du magazine New York Times critiquait le site de santé et l'accusait d'être synonyme de « Big Pharma Shilling » en raison de ses liens avec des sociétés pharmaceutiques. L'article soulignait que les consommateurs cherchant des conseils sur le site étaient fréquemment confrontés à des tactiques alarmistes. Ce climat de peur peut provoquer l'hystérie et persuader les consommateurs d'acheter des médicaments à l'une des sociétés pharmaceutiques pour soigner leur maladie.
