La classification taxonomique d'une mouche domestique, dont le nom scientifique est musca domestica, est la suivante : règne Animalia, phylum Arthropoda, classe Insecta, ordre Diptera, section Schizophora, famille Muscidae, genre Musca et espèce Musca domestica. Les mouches domestiques sont les mouches les plus courantes et se trouvent le plus souvent dans les régions tempérées.
Cette classification indique que la mouche domestique est un animal invertébré. C'est un arthropode, ce qui signifie qu'il a un exosquelette et des pattes articulées. La classe Insecta signifie que la mouche domestique est un animal avec une tête, un thorax et un abdomen et trois paires de pattes articulées.
La mouche se trouve partout dans le monde mais prospère là où se trouvent les humains. En effet, les déchets humains constituent l'environnement idéal pour la ponte des œufs et le développement des larves.