Il n'y a qu'un seul prédateur documenté des boas émeraude sont les aigles huppés de Guyane. Cependant, de nombreux autres oiseaux de proie, tels que les aigles harpies, sont certainement capables de tuer et de manger les boas. De plus, les grands félins, comme les jaguars, mangent probablement des boas émeraude lorsqu'ils les trouvent.
Les principaux moyens par lesquels les boas émeraude se protègent des prédateurs incluent leur incroyable camouflage, leurs habitudes arboricoles et leur cycle d'activité nocturne. Les boas émeraude sont de couleur vert foncé, mais ils présentent également un assortiment de marques blanches, jaunes, grises et bleues. La coloration verte aide les serpents à se fondre dans le feuillage vert de la canopée de la forêt tropicale, tandis que les marques colorées aident à briser le contour des serpents. Passant la majeure partie de la journée à dormir enroulés autour d'une branche, les boas émeraude se réveillent après la tombée de la nuit pour chasser. S'ils sont attaqués par un prédateur, les boas émeraudes s'accrochent avec ténacité à leur branche et frappent vigoureusement.
Les boas émeraude ont une vision adéquate, mais la principale façon dont ils détectent les prédateurs est l'odorat. À l'aide de leur langue fourchue, les boas émeraude peuvent sentir les prédateurs avant même d'être suffisamment proches pour être vus. Les boas émeraude utilisent également leur excellent sens de l'odorat pour localiser, suivre et attraper des proies, telles que des rongeurs et des grenouilles.