Il n'y a pas une seule église baptiste du Sud ou une alliance universelle de l'église baptiste du sud. Une église baptiste du sud est une église qui s'identifie comme membre de la communauté des églises baptistes du sud, embrasse les enseignements bibliques et traditions par lesquelles les baptistes du Sud s'identifient, coopèrent et soutiennent les missions de la Convention et apportent un soutien financier régulier aux travaux de la Convention. Chaque église est unique et autonome et maintient ses propres directives sur ses activités, ses opérations et ses pratiques.
Cette autonomie est un aspect fondamental de la tradition baptiste du Sud et permet aux décisions importantes qui affectent les membres d'être prises par les églises individuelles au niveau de la congrégation. Pour cette raison, le SBC n'est pas disposé et incapable de prendre des mesures ou des positions officielles sur des questions telles que les abus sexuels commis par des responsables de l'église, l'homosexualité et l'avortement, et permet aux églises individuelles d'établir leurs positions officielles ou de prendre les mesures appropriées.
La Southern Baptists Convention est un réseau de plus de 47 000 églises individuelles qui se sont réunies pour former un cadre organisationnel qui permet aux églises coopérantes de poursuivre des missions liées à l'éducation chrétienne et aux services sociaux. Les aspects clés de la Convention sont une croyance en Christ en tant que fils de Dieu et sauveur de l'humanité, attestée par le baptême par une immersion totale, et l'acceptation complète de la Bible comme parole littérale de Dieu, ainsi qu'une mission évangélique pour établir la foi pour le monde.
La Convention a adopté une Déclaration de foi et de message baptiste largement acceptée, qui contient 18 articles de foi et fournit un aperçu général de sa doctrine. Cette déclaration est une version révisée de la Confession de Foi et d'Alliance originale du New Hampshire, à laquelle souscrivent la plupart des églises coopérantes.