Aye-ayes sont en danger principalement en raison de la destruction de leur habitat, car les humains ont rapidement empiété sur leurs habitats. Ils sont également fréquemment tués par les Malgaches indigènes qui les considèrent comme des parasites des cultures et de mauvais présages. Les Aye-ayes habitent parfois des plantations de noix de coco et de litchi.
Aye-ayes sont répandus sur l'île de Madagascar dans une variété d'environnements. Ils vivent dans les forêts tropicales humides, les forêts de feuillus, les forêts de broussailles sèches et les forêts de mangroves. Ils ont des besoins caloriques relativement élevés et consomment des fruits, des noix, des fluides végétaux et des larves d'insectes pour se maintenir. Les aliments végétaux consommés comprennent les mangues, les fruits à pain, les bananes, les noix de coco, le nectar de l'arbre du voyageur et le bambou.
Aye-ayes chasse aux larves xylophages en utilisant la recherche de nourriture par percussion ; ils tapent sur l'écorce d'un arbre pour écouter les creux laissés par les larves. Ils tapent avec leurs troisièmes doigts spécialisés, qui sont extrêmement longs, fins et flexibles. Une fois qu'ils trouvent une cavité, ils l'ouvrent avec leurs incisives agrandies. Ils utilisent à nouveau leurs troisièmes doigts spécialisés pour pêcher les larves.
Leurs longs doigts sont délicats, les oui-oui doivent donc faire particulièrement attention lorsqu'ils bougent pour éviter de les endommager. Ils recourbent leurs doigts et distribuent plus de contraintes à leur arrière-train que de nombreux primates grimpants à cette fin. Malgré cela, ce sont des grimpeurs extrêmement habiles, capables de sauter à travers les arbres et de descendre les arbres la tête la première.