Les souris vivent dans presque tous les pays de la planète, et elles s'installent généralement dans diverses structures artificielles, notamment des fermes, des mines, des maisons, des entrepôts et des bureaux. Les souris sauvages vivent dans une grande variété d'espaces extérieurs, y compris les terres arables, les pâturages, les dunes et les plaines côtières, les marais et les forêts. Le changement de saison peut affecter l'habitat, amenant les souris d'extérieur à tenter de se déplacer vers les zones intérieures avec plus de chaleur et d'abri.
Les souris qui vivent à l'intérieur peuvent vivre dans divers endroits, même à l'intérieur d'une habitation humaine. Les souris s'enfouissent dans les murs, l'isolation, les greniers, les vides sanitaires et même les meubles rembourrés. Les souris sont petites et peuvent s'insérer dans des endroits incroyablement petits, et peuvent creuser dans des matériaux tels que le bois, le plâtre et la brique endommagée, et elles peuvent ramper à travers les tuyaux, les treillis et les câbles. Ils peuvent également faire leurs maisons dans des machines et des véhicules. Les souris vivent également autour des habitations humaines, en particulier dans les champs, les forêts et les terres agricoles où la nourriture est abondante.
Les souris sont originaires d'Asie, mais se cacher sur les navires des colons européens a conduit à leur introduction dans un certain nombre de nouveaux habitats. En Nouvelle-Zélande, en Australie et dans l'Atlantique Sud, les souris sont considérées comme des espèces envahissantes, et elles ont atteint des proportions qui causent des dommages aux communautés et aux cultures dans les zones où elles vivent.