L'eau et les déchets des toilettes vont soit dans une fosse septique locale, soit dans le système d'égout une fois qu'ils sont rincés. Les systèmes septiques locaux décomposent les déchets solides et s'écoulent généralement dans le sol d'une cour, tandis que les systèmes d'égout transportent les déchets vers une usine de traitement des eaux.
Les maisons et les entreprises qui n'ont pas de système septique local envoient les déchets des toilettes aux égouts locaux. De là, les eaux usées s'écoulent vers les stations d'épuration. Les eaux usées passent généralement d'abord par une canalisation où les gros objets solides sont filtrés. Les déchets de matériaux sont transformés en boues et décomposés par des microbes à un stade ultérieur du traitement.