La source de la rivière Missouri est située à Brower's Spring à la source de l'affluent connu sous le nom de Jefferson River. Brower's Spring a été découverte dans les montagnes du Centenaire par Jacob V. Brower dans les années 1890.
La source d'une rivière est définie comme le point de la rivière qui est le plus éloigné de son extrémité. Cependant, lorsque Lewis et Clark ont atteint la zone qui est maintenant le Missouri Headwaters State Park, Lewis a décidé qu'aucune des trois fourches n'était supérieure aux autres et a déclaré que l'emplacement à trois fourches était la source du Missouri. Par conséquent, pour déterminer la source du Missouri, la Lewis and Clark Trail Heritage Foundation a dû déterminer lequel des trois affluents est le plus long.
