La rivière Missouri commence près de Three Forks, Montana, et s'écoule jusqu'à ce qu'elle fusionne avec la rivière Mississippi près de St. Louis, Missouri. La rivière Missouri s'étend sur 2 341 miles.
Les eaux de la rivière Missouri proviennent de la confluence des rivières Jefferson, Madison et Gallatin. La rivière était très sujette aux inondations lorsque la région a commencé à être colonisée par les colons européens. Ces inondations étaient un élément clé de l'écosystème de la région. Aujourd'hui, la rivière est retenue par 15 barrages le long de son tracé principal, et les barrages ont modifié les crues et le tracé de la rivière. La zone appelée la vallée du Missouri est maintenant très peuplée et n'est plus inondée comme par le passé, mais ces actions ont eu un impact sur la qualité de l'eau et ont eu un lourd tribut sur les poissons et la faune.
