En 2014, la Liste rouge de l'Union internationale pour la conservation de la nature et des ressources naturelles attribue aux ornithorynques la classification la moins préoccupante, ce qui signifie qu'ils ne sont pas en danger. Les ornithorynques sont une espèce protégée dans leur pays d'origine, l'Australie depuis 1905, et restent communs dans l'est de l'Australie. Les menaces possibles incluent l'enchevêtrement dans le matériel de pêche et la perte d'habitat en raison de la dégradation du débit de la rivière.
Les ornithorynques vivent dans les lacs, les rivières et les ruisseaux de divers terrains de l'est de l'Australie. Ils écument le fond des rivières et des lacs pour se nourrir, comme des vers, des crevettes et des larves, et chassent près de la surface pour les poissons, les grenouilles et les insectes. Ils creusent de longs terriers dans les berges des rivières pour s'abriter. Leur comportement aquatique les rend vulnérables aux modifications du débit normal des cours d'eau. La sécheresse, la régulation humaine des cours d'eau et le siphonnage de l'eau à des fins industrielles, agricoles et domestiques menacent les habitats des ornithorynques. Les inondations dues aux cyclones tropicaux mettent également leurs habitats aquatiques en danger. De plus, la pollution et les pièges installés dans les cours d'eau pour attraper des crustacés et des poissons constituent une menace potentielle pour les populations d'ornithorynques.
Outre son statut officiel d'animal protégé en Australie, les efforts de conservation des ornithorynques se concentrent sur le maintien des populations dans un certain nombre de sanctuaires animaliers australiens. Bien que des tentatives aient été faites pour exporter des ornithorynques vers des zoos dans d'autres parties du monde, ils n'ont pas bien survécu en dehors de l'Australie.
