À plus forte dose, l'eau de Javel tuera les plantes alors que l'eau de Javel oxygénée ne le fera pas. Beaucoup de gens utilisent un mélange d'eau de Javel et d'eau pour tuer les mauvaises herbes. Quelle que soit la quantité, l'eau de Javel peut être dangereuse pour les plantes.
Parce que l'ingrédient principal de l'eau de Javel est l'élément chlore, il peut provoquer un phénomène dans les plantes connu sous le nom de toxicité du chlore. Cependant, les plantes ont besoin d'une certaine quantité de chlore dans le sol pour rester en bonne santé. Lorsque l'eau de Javel est ajoutée à leur environnement, ils sont exposés à trop de chlore, ce qui brunira le bout de leurs feuilles. Ils développent un aspect "brûlé" et peuvent même développer des taches d'eau de Javel sur leurs feuilles.