Bien que de nombreux fumeurs de narguilé choisissent d'inhaler la fumée de tabac souvent savoureuse, les effets sont nocifs, selon « Men's Health ». Bien que cela expose l'utilisateur à des agents cancérigènes différents de ceux trouvés dans les cigarettes, ils ne sont pas moins dangereux.
Une étude réalisée en 2013 par l'Université de Californie à San Francisco a révélé que la présence de benzène dans le narguilé était plus du double de la quantité trouvée dans les cigarettes. L'étude a également révélé que les niveaux de monoxyde de carbone du narguilé étaient le triple de ceux de la fumée de cigarette. En n'inhalant pas la fumée, les utilisateurs de narguilé absorbent moins de produits chimiques toxiques dans leurs poumons, ce qui les expose à un risque beaucoup plus faible de crise cardiaque, d'accident vasculaire cérébral et de cancer du poumon.