Bien qu'une liste écrite de tous les Yu-Gi-Oh! cartes à collectionner est difficile à trouver en raison du grand nombre de cartes qui ont été imprimées au fil des ans, les bases de données en ligne organisées donnent une bonne idée de la majorité des cartes imprimées. Il existe même certaines de ces bases de données qui sont des cartes à collectionner en ligne bases de données.
D'autres bases de données donnent également un aperçu des différents types de Yu-Gi-Oh! cartes, et notamment ranger ces cartes selon la source ou le type. Par exemple, un site fournit une liste des cartes interdites et limitées. Un autre site fournit une liste de cartes organisées selon les boîtes ou les packs d'édition spéciale dans lesquels elles sont vendues.