On peut déterminer si un cobaye veut s'accoupler en observant son comportement seul et en présence du sexe opposé. Les cobayes femelles peuvent être agitées et anxieuses lorsque la saison des amours arrive. Le cobaye mâle essaie généralement de monter une femelle à plusieurs reprises lorsqu'il reconnaît qu'elle est en chaleur.
Un propriétaire de cobaye souhaite souvent contrôler l'élevage de ses animaux de compagnie, il est donc utile de pouvoir identifier quand les animaux sont en chaleur. La membrane recouvrant la zone vaginale s'ouvre pour préparer le processus d'accouplement lorsque la femelle cobaye est en chaleur, et elle se referme une fois le besoin de s'accoupler passé. Les cobayes mâles manifestent un fort désir de monter la femelle cobaye lorsqu'elle est en chaleur.
Une autre façon de savoir si un cobaye est prêt à s'accoupler est de placer deux cobayes du sexe opposé dans la même cage l'un avec l'autre. Si les cobayes sont prêts à s'accoupler, ils essaieront de le faire. Pour éviter qu'une cobaye ne tombe enceinte, il est important de la tenir éloignée des cobayes mâles lorsqu'elle est en chaleur ; sinon, les animaux peuvent s'accoupler. Le cochon d'Inde femelle entre généralement en chaleur toutes les quelques semaines pendant deux jours, ce qui rend crucial de garder un œil sur ces animaux autour des cochons d'Inde mâles non stérilisés.
