Les joueurs ne peuvent pas attraper Kyogre en jeu dans Pokémon Soul Silver. Cependant, les joueurs peuvent le transférer via Pal Park à partir d'un certain nombre d'autres jeux Pokémon.
Dans Pokémon Heart Gold, les joueurs peuvent trouver Kyogre dans la tour intégrée, accessible depuis une grotte de la route 47 si les joueurs possèdent l'orbe bleu. Lorsque les joueurs atteignent le même point dans Soul Silver avec l'Orbe rouge en leur possession, ils trouvent Groudon qui les attend à la place.
Les joueurs ne peuvent obtenir Kyogre dans Soul Silver qu'en échangeant pour lui, ou en l'important d'un autre jeu. Kyogre est disponible dans la grotte d'origine dans Pokémon Saphir ou dans la grotte marine dans Pokémon Émeraude. Étant donné que ces jeux n'étaient disponibles que pour la Game Boy Advance, ils nécessitent cependant un modèle de Nintendo DS doté de l'emplacement de cartouche approprié. Les joueurs qui ont un modèle DSi ou 3DS ne pourront pas obtenir Kyogre de cette façon et doivent échanger pour lui ou utiliser une copie de Heart Gold.
Kyogre est un Pokémon légendaire, et dans tous les jeux, il commence au niveau 50. Les joueurs devront être à un niveau assez élevé pour gagner la bataille, et doivent se préparer à de fortes attaques de glace et d'eau.
