Un système siphonique de toilettes utilise le déplacement d'eau pour créer un vide qui aspire le contenu de la cuvette des toilettes dans le tuyau d'évacuation. Les toilettes équipées d'un système siphonique ont un diaphragme en caoutchouc relié à la poignée de chasse . Une pression sur la poignée soulève le diaphragme, déplaçant une quantité d'eau du réservoir dans le bol. L'afflux d'eau pousse le contenu du bol dans le tuyau d'évacuation.
Les toilettes siphoniques sont le type de toilettes le plus répandu aux États-Unis. L'autre style, appelé toilettes à fond plat, est plus populaire en Europe. Lorsqu'une toilette à fond plat tire la chasse d'eau, l'eau du réservoir de la toilette pénètre dans la cuvette et déplace les déchets qui s'y trouvent, les forçant à descendre dans le tuyau d'évacuation. Les toilettes à fond creux n'utilisent pas l'action d'aspiration qui caractérise les toilettes siphoniques.
Il existe plusieurs autres styles de toilettes. Selon Greywater Action, l'un des plus inhabituels est la toilette sèche à compost. Ces toilettes utilisent des bactéries bénéfiques pour décomposer les déchets humains. Certaines toilettes à compost nécessitent de petites quantités d'eau de chasse, tandis que d'autres n'en utilisent pas du tout. Ce type de toilettes permet une élimination pratique des déchets dans les zones où l'eau est rare. Ils sont souvent installés dans les parcs et les aires de repos rurales. Les toilettes à compost sont particulièrement populaires au Royaume-Uni, en Suède et aux États-Unis.