Spirit Airlines propose aux voyageurs trois méthodes pour enregistrer leurs bagages pour leurs vols : l'espace pour les bagages des voyageurs peut être acheté en ligne jusqu'à 24 heures avant le départ, en personne à l'aéroport ou par téléphone auprès de la centrale de réservation de Spirit Airlines. Les voyageurs qui enregistrent leurs bagages en ligne paient les frais d'enregistrement de bagages les plus bas.
Depuis mai 2015, Spirit Airlines facture plus pour les enregistrements de bagages qui ont lieu par téléphone ou au terminal de l'aéroport, car ces activités nécessitent l'assistance d'un agent du service client et ralentissent par conséquent le processus d'enregistrement pour tous les autres passagers. Les voyageurs qui accèdent à leurs informations de vol en ligne plus de 24 heures avant le départ peuvent enregistrer un bagage via l'onglet Gérer le voyage sur la page d'informations de vol sur le site Web de Spirit Airlines.
Spirit Airlines permet à chaque passager de transporter gratuitement un seul petit sac et facture chaque bagage supplémentaire en fonction de la manière dont le passager choisit de l'enregistrer. Depuis mai 2015, l'enregistrement d'un seul bagage via le service en ligne de Spirit Airlines avant l'enregistrement coûte 26 $, tandis que le même bagage coûte 50 $ s'il est enregistré au bureau de groupe de l'aéroport ou via le centre de réservation téléphonique. Si un passager oublie d'enregistrer un sac jusqu'à son arrivée à la porte de l'aéroport, Spirit Airlines facture 100 $ par article.