Une procédure de cystoscopie coûte généralement 386 $ pour les honoraires du médecin et elle est généralement effectuée dans le cabinet du médecin, selon le Healthcare Blue Book. Avec l'assurance maladie, le coût correspond à la quote-part plus 10 à 50 % du coût de la procédure ou 350 $ à 3 000 $ sans assurance, selon CostHelper.
Si la cystoscopie est réalisée dans un centre de chirurgie ambulatoire, le patient paie des frais supplémentaires pour l'établissement et éventuellement pour l'anesthésie. Le patient doit demander au médecin si la procédure doit être effectuée dans un centre de chirurgie en raison de l'état de santé du patient, de son état ou d'une procédure spécifique. Sinon, le coût peut être maintenu bas en effectuant la procédure dans le cabinet du médecin, selon le Healthcare Blue Book.