Les protons ont tous la même masse ; la masse de chaque proton est de 938,27 mégaélectronvolts, soit 1,6726231*10-27 kilogrammes. En fait, tous les protons sont identiques, de même que tous les électrons et tous les neutrons, bien que chacune de ces trois particules subatomiques soit distinct des deux autres types. Les protons et les neutrons ont presque la même masse, les protons ne pesant que légèrement moins que les neutrons (1,6749286*10-27 kg), mais les électrons sont plus légers que les protons et les neutrons, pesant 9,1093897*10< sup>-31 kg.
Les protons, les neutrons et les électrons sont des particules subatomiques qui composent tous les atomes. Les atomes sont les éléments constitutifs de tout dans l'univers. Les protons et les neutrons constituent le noyau de l'atome ; les protons et les neutrons fournissent la majeure partie du poids d'un atome, de sorte que la majorité de la masse d'un atome se trouve dans le noyau, le mince nuage d'électrons externe fournissant relativement peu de poids.
Dans une unité de masse différente, un proton correspond à 1,007316 unités de masse atomique, tandis qu'un neutron correspond à 1,008701 unités de masse atomique. Parce qu'Einstein a prouvé que la masse et l'énergie sont identiques (E = mc2), il est possible pour les scientifiques d'utiliser l'une ou les deux unités d'énergie et unités de masse pour mesurer la masse d'un proton.