L'État de l'Indiana abrite un certain nombre de plans d'eau importants. Les fleuves les plus grands et les plus importants sont le Wabash et l'Ohio. De plus, une partie importante de la frontière nord de l'Indiana se compose de la plage le long du lac Michigan, l'un des cinq Grands Lacs.
L'Indiana jouxte le lac Michigan au nord-ouest, une région qui fournit à l'Indiana certains de ses habitats naturels et refuges touristiques les plus précieux. Selon le site officiel de l'État, le parc national des Dunes possède à lui seul 25 miles de plage de choix à partir de la ville de Gary ; le parc accueille plusieurs millions de visiteurs chaque année. La frontière sud de l'Indiana est formée par la rivière Ohio, une rivière qu'elle partage avec cinq autres États, à savoir l'Illinois, le Kentucky, l'Ohio, la Pennsylvanie et la Virginie-Occidentale. Le Wabash, un autre fleuve majeur de l'Indiana, fait partie de sa frontière sud-ouest avant de traverser les comtés du centre.
La rivière Wabash s'étend sur 475 miles depuis sa confluence avec la rivière Ohio au sud, drainant finalement 92 comtés de l'Indiana et de l'Illinois. Les lacs intérieurs de l'Indiana, le lac Patoka et le lac Monroe, sont les plus grands et tous deux sont situés dans la partie centre-sud de l'État. Les sources naturelles incluent Cartersburg et West Baden.