La programmation structurée, telle que l'utilisation du langage de programmation C, prend plus de mémoire de l'ordinateur. Un programme développé à l'aide de l'approche structurée peut mal fonctionner lorsque le nombre de modules qu'il contient dépasse une certaine plage. L'approche est restreinte à la résolution d'un problème spécifique et ne bénéficie pas des avantages de la programmation orientée objet, qui est une méthode largement orientée.
La programmation structurée n'est pas adaptée au développement de grands programmes et ne permet la réutilisation d'aucun ensemble de codes. Il est mis en œuvre par un raffinement progressif de la fonctionnalité, ce qui entraîne une structure instable et entraîne une mauvaise exécution des fonctions, des actions ou du contrôle. De telles faiblesses obligent les programmeurs à explorer des techniques de programmation qui se concentrent sur les structures de données et pas seulement sur les structures de contrôle.
La méthode suit une approche descendante ; par conséquent, il ne parvient pas à relever les défis des systèmes réels, qui n'ont pas de sommet unique. La programmation orientée objet est préférée car, contrairement à l'alternative structurée, elle permet aux programmeurs de procéder à partir de n'importe quel point, comme le milieu, vers la fin ou le bas d'un programme. Ses codes sont réutilisables dans un programme.
La programmation structurée a ses points forts, comme sa facilité d'utilisation avec des organigrammes et sa décomposition en composants plus petits. L'approche est facile à tester et à corriger module par module. Il est facile à entretenir.