Les effets secondaires les plus courants de la mélasse sont les selles molles et la diarrhée, comme indiqué par Ayur Times. Les personnes qui prennent plus de 3 cuillères à café de mélasse par jour peuvent également ressentir des ballonnements abdominaux, des douleurs et des crampes.
Certaines personnes ressentent des étourdissements ou des nausées lorsqu'elles prennent de la mélasse pour la première fois, il est donc préférable de la prendre avec de la nourriture ou l'estomac plein, selon Ayur Times. Les personnes allergiques à la canne à sucre doivent éviter la mélasse. Les femmes enceintes ou qui allaitent devraient consulter un médecin avant de prendre régulièrement de la mélasse, tout comme les personnes ayant une glycémie élevée.