Il existe de nombreux codes GameShark pour Metroid Fusion sur Game Boy Advance, selon BS Free. Afin d'entrer ces codes, la cartouche de jeu doit être insérée dans l'appareil GameShark, puis insérée dans la Game Boy Advance. Tout d'abord, entrez le code d'activation : « 00000F6D 000A » et « 100008B4 0007 ». La saisie de ces codes permet d'activer toutes les autres astuces.
Pour activer le code d'invulnérabilité, saisissez "33001249 0001". Cela permet à Samus d'éviter les dégâts tout au long du jeu. Arrêtez le chronomètre d'événement en entrant " 830008D8 00DA ". Des prises de vue plus rapides sont activées en entrant "3300124E 0000". Ce code permet à Samus d'effectuer des tirs rapides sans pause entre les tirs.
Le code "83001252 A001" permet une course rapide, permettant à Samus de courir à vitesse maximale sans fatigue. Pour activer le saut de lune, entrez "74000130 03FE" et "83001260 0040". Le saut de lune donne à Samus une hauteur de saut considérablement augmentée. Pour les missiles infinis, entrez " 83001314 03E7 ". Pour avoir un maximum, mais pas un nombre illimité de missiles, entrez " 83001316 03E7 ". Le code "33001318 0063" arme Samus d'un nombre infini de super bombes.
Si un joueur recherche une forme de jeu extra-difficile, il peut désactiver tous les missiles et bombes avec le code "3300131B 0000". Déverrouillez toutes les armes, combinaisons et capacités spéciales avant de les obtenir via le jeu normal en entrant "4300131A FFFF" et "00000003 0002". Entrez "820382E4 0000" pour suspendre le chronomètre du jeu et réglez-le sur 00:00.
