Les principales ressources naturelles du Kenya comprennent la pêche, l'eau, les forêts, les zones humides, la biodiversité et une variété de minéraux. Ces minéraux comprennent le calcaire, les pierres précieuses, le sel, le zinc, le gypse, la diatomite, le calcaire et autres.
La base de ressources naturelles du Kenya est menacée par les activités socio-économiques, telles que l'agriculture, le commerce, le tourisme et les établissements humains. Le pays est également confronté à la pollution de l'eau par les déchets d'origine humaine, le braconnage et la déforestation. L'utilisation d'engrais chimiques et de pesticides entraîne également une mauvaise qualité de l'eau. En raison de lois inadéquates concernant l'utilisation des terres et des ressources naturelles, le Kenya a connu une mauvaise gestion des ressources et des terres ainsi que des conflits fonciers qui ont conduit à des inégalités et à une pauvreté généralisée.
La géographie du Kenya est composée de basses plaines s'élevant dans des hautes terres qui cèdent la place à la vallée du Grand Rift. Les deux principaux fleuves du Kenya sont le Tana et le Galana, et un plateau fertile se trouve à l'ouest du pays. Un peu plus de 1 % des terres sont occupées par des cultures permanentes, mais plus de 9 % sont arables.
Le Kenya est confronté à des inondations pendant la saison des pluies ainsi qu'à une grave sécheresse à d'autres moments de l'année. Il y a aussi une certaine activité volcanique, et la majeure partie de la géologie du pays est dominée par la tectonique du rift le long de la vallée du Grand Rift.