En septembre 2015, bien qu'aucune plainte officielle n'ait été déposée auprès du Better Business Bureau, ou BBB, contre le Whitaker Wellness Institute Medical Clinic, Inc., de nombreuses plaintes de consommateurs ont été déposées auprès du National Council Against Health Fraud, ou NCAHF. Ces plaintes incluent la promotion par Whitaker des mégavitamines pour des utilisations inappropriées et le fait que le Dr Whitaker, un praticien de médecine alternative, n'est pas certifié en médecine préventive, selon le Conseil national contre la fraude en matière de santé.
Une plainte courante contre le Dr Whitaker est qu'il dénature les points de vue de la profession médicale en général, explique le Conseil national contre la fraude en matière de santé. Par exemple, sur son site Web DrWhitaker.com, il décrit les « trois plus gros mensonges racontés par la profession médicale », y compris « la maladie survient tout simplement », « les personnes âgées ont toujours des problèmes médicaux » et « vous ne pouvez rien y faire ». Ces affirmations sont fausses car la médecine ordinaire ne croit ni n'avance ces propositions. C'est ce qu'on appelle une tactique d'"homme de paille" utilisée pour faire paraître Whitaker supérieur aux autres médecins.
Une autre plainte contre le Dr Julian Whitaker est qu'il est un promoteur de la thérapie par chélation pour les maladies vasculaires, note le National Council Against Health Fraud. La thérapie par chélation est un processus chimique dans lequel une solution synthétique est injectée dans la circulation sanguine pour éliminer les métaux lourds ou les minéraux du corps. Bien qu'approuvée pour la détoxification des métaux lourds, la thérapie par chélation n'est pas approuvée pour les maladies vasculaires ou tout autre problème médical, mais est fréquemment utilisée par le Dr Whitaker.
