Les racines des plantes sont des structures développées pour extraire les nutriments et l'humidité du sol tandis que les tubercules servent de récipients de stockage et de moyen de propagation de nouvelles plantes. Les plantes forment des tubercules sur leurs racines et leurs tiges. Les tubercules souches contiennent des cellules souches qui permettent aux plantes de se reproduire en formant de nouvelles tiges et feuilles. Les tubercules racines ne sont pas de vrais tubercules car ils n'ont pas de cellules souches ou de feuilles supprimées.
La pomme de terre commune est un tubercule à tige. Lorsque les pommes de terre sont plantées à partir de graines, les ramifications poussent à partir de la tige près du sol, souvent suffisamment près pour que le sol les recouvre finalement. Dans la nature, ces tubercules dorment par temps froid, puis des germes se forment à mesure que le sol se réchauffe, propageant éventuellement la plante pour former de nouvelles plantes génétiquement identiques. La base du tubercule forme le système racinaire tandis que le sommet forme les nouvelles tiges et feuilles.
Les patates douces sont des tubercules racines. Ils se forment sur les rhizomes ou les racines horizontales de la plante. Les tubercules racinaires ne sont constitués que de cellules racinaires. Pour propager les tubercules racinaires, chaque plante a besoin d'une partie de la coiffe racinaire qui forme de nouvelles cellules souches.
Les carottes, betteraves et navets sont de véritables tubercules et non des tubercules. Bien que ces racines pivotantes modifiées stockent de l'énergie, elles ne propagent pas de nouvelles plantes.
