Alors qu'un four autonettoyant peut faire gagner beaucoup de temps et de tracas dans la cuisine, les fours extrêmement sales nécessitent un pré-nettoyage au préalable. L'exécution du cycle d'autonettoyage avec une quantité extrême de saleté peut nécessiter plusieurs cycles et peut même endommager les surfaces à l'intérieur du four.
Le cycle d'autonettoyage utilise une chaleur extrême pour incinérer les résidus alimentaires. Certains types de déversements deviennent problématiques à haute température. Les résidus sucrés peuvent s'enflammer et endommager l'intérieur de la surface du four. Les saletés très collées peuvent bloquer le flux d'air, provoquant une surchauffe des éléments et éventuellement une panne électrique. Plus il y a de matière à enlever, plus le four doit travailler longtemps pour la brûler.
