Selon son site officiel, Ernestine Shepherd mange sept petits repas par jour qui sont équilibrés sur le plan nutritionnel pour répondre à ses besoins d'entraînement, avec beaucoup de protéines et de vitamines afin qu'elle n'ait pas à trop se supplémenter. Shepherd reçoit de l'aide pour son alimentation de la part de son mari et d'un nutritionniste professionnel.
Le régime d'Ernestine Shepherd se concentre principalement sur les blancs d'œufs à la coque, le poulet, les légumes et une boisson aux blancs d'œufs liquide, ce qui garantit qu'elle a suffisamment de protéines et de nutriments sans excès de calories. Elle prend des suppléments de vitamine D, car il s'agit d'un nutriment difficile à obtenir uniquement à partir de son alimentation et car la synthèse cutanée appropriée à partir du soleil est difficile à gérer.
Malgré la répartition de sa nourriture sur de nombreux repas, Ernestine Shepherd ne consomme qu'environ 1 700 calories par jour, bien en deçà de la consommation quotidienne standard suggérée par les nutritionnistes pour une femme de 2 000 personnes. Cependant, la composition nutritionnelle soignée de son alimentation garantit toujours qu'elle a l'énergie nécessaire pour effectuer un programme d'exercice intense qui comprend la course jusqu'à 80 miles par semaine en plus de la musculation régulière.
Shepherd consacre également son temps et son énergie à former d'autres femmes âgées sur la façon d'améliorer leur condition physique. Elle structure soigneusement les périodes de repos dans son emploi du temps.