Joe Scarborough a divorcé en janvier 2013, selon TMZ. Le couple a commencé une procédure de divorce en septembre 2012, et selon les termes d'un accord, ils partagent la garde conjointe de leurs deux enfants mineurs, à partir d'octobre 2015.
Joe Scarborough a réglé les conditions de son divorce d'avec son épouse Susan Waren en acceptant de verser à Susan une pension alimentaire de 30 000 $ par mois pendant cinq ans, suivie de 25 000 $ par mois pendant encore deux ans. Le couple continue de partager l'occupation du domicile conjugal.
Scarborough dément les rumeurs d'une relation amoureuse avec Mika Brzezinski, son co-animateur de "Morning Joe" sur MSNBC. L'ex-femme de Scarborough, Susan, travaillait auparavant pour l'ancien gouverneur de Floride Jeb Bush. Avant de co-animer "Morning Joe", Scarborough était membre du Congrès américain.
