La commande respiratoire, ou contrôle respiratoire, fait référence au processus par lequel les changements détectés dans les niveaux de pH et de PCO2 du corps sont traités par la stimulation corrective du rythme par le système nerveux central, effort et rythme respiratoire. Le contrôle et la réponse du système respiratoire ont lieu dans la moelle du tronc cérébral. La moelle épinière sert de conduit par lequel les signaux neuronaux appropriés sont transmis aux muscles de la respiration.
La conduite respiratoire est affectée par les niveaux de dioxyde de carbone dans le sang. Les changements de niveau sont détectés par les chimiorécepteurs centraux dans la moelle et par les chimiorécepteurs périphériques dans l'artère carotide et l'aorte. La boucle de rétroaction et les signaux neuronaux qui en résultent modifient les schémas respiratoires en conséquence et le corps est capable de maintenir les bons rapports acide-base et O2-à-CO2 .