Bien qu'il soit possible d'accoupler un chien mâle avec sa fille, c'est un processus connu sous le nom de consanguinité et peut créer des problèmes dans la progéniture. Les animaux consanguins, qui sont généralement consanguins pour préserver les traits préférés, ont une incidence plus élevée d'anomalies génétiques récessives devenant des traits invalidants.
Certaines mutations négatives courantes chez les chiens consanguins incluent la dysplasie de la hanche et la luxation de la rotule. Les chiens consanguins souffrent également d'un système immunitaire plus faible et d'une faible fertilité, et ont tendance à être moins intelligents et, par conséquent, moins faciles à dresser que les chiens non consanguins. Les chiens consanguins peuvent également être plus agressifs et présenter plus de problèmes de comportement que leurs homologues non consanguins.
