L'emplacement absolu de Tokyo, au Japon, est à la latitude de 35 degrés 41 minutes au nord et à la longitude de 139 degrés 41 minutes à l'est. Tokyo est situé autour de la partie centrale de l'archipel japonais, au sud du district de Kanto à Honshu, l'île principale du pays.
Tokyo partage une frontière avec quatre districts administratifs, à savoir la préfecture de Saitama, la préfecture de Chiba, la préfecture de Yamanashi et la préfecture de Kanagawa. Tokyo, Chiba, Kanagawa et Saitama constituent la région de la mégalopole de Tokyo, avec quatre autres préfectures supplémentaires, Gunma, Yamanashi, Ibaraki et Tochigi constituant la région de la capitale nationale. Tokyo reste le centre technologique et commercial de la région de Kanto au Japon.