Le Weather Institute de Pokémon Émeraude est situé sur la route 119. Servant de bureau pour la région de Hoenn, il surveille les conditions météorologiques dans toute la région.
Lorsque le joueur arrive à l'institut pour la première fois, le joueur découvrira qu'il a été envahi par la Team Aqua ou la Team Magma pour rechercher des informations sur le légendaire Pokémon Kyogre (Team Aqua) ou Groudon (Team Magma) et le rare Pokémon Castform. Une fois que le joueur a battu l'équipe qui a envahi l'institut, un météorologue récompensera le joueur avec Castform.
Le projet principal de l'Institut météorologique est une machine météorologique qui permet à l'institut de contrôler la météo dans les zones de la région de Hoenn. Le premier étage dispose d'un PC et d'un lit où le joueur peut se reposer. Le deuxième étage est l'endroit où se trouvent les postes de travail de l'institut, et c'est aussi la zone où le personnel est rassemblé par l'équipe d'invasion.