La principale différence entre Nidoking et Nidoqueen est qu'ils proviennent de lignées sexuelles différentes des Nidoran. En apparence, les deux Pokémon sont presque les mêmes à l'exception des nombres de base. Ils possèdent des ensembles de mouvements très similaires, ce sont tous deux des Pokémon Poison/Sol et ils proviennent de lignées évolutives similaires.
Cette disparité entre les sexes est le premier et le plus marquant de la série Pokémon. Le genre en tant que mécanisme de jeu complet a été introduit pour la première fois dans la deuxième génération de jeux, mais les Nidorans ont montré un exemple de base de ce qu'il deviendrait finalement dans les générations suivantes. Même dans les dernières versions, les lignées Nidoran présentent plus de différences entre leurs sexes que les autres, car elles sont l'une des très rares à développer des stratégies et des forces différentes uniquement en fonction de leur sexe.
Les lignées Nidoran sont considérées comme des espèces distinctes les unes des autres, mais elles possèdent une parfaite compatibilité les unes avec les autres. Malheureusement, cela ne se poursuit pas tout au long de leurs lignes évolutives en raison de bizarreries avec le fonctionnement de l'élevage de Pokémon au début de la série. Curieusement, une fois qu'une femelle Nidoran évolue vers une Nidorina, elle perd toute compatibilité avec les œufs, ce qui rend impossible la reproduction avec autre chose qu'un Idem.