Après avoir terminé "End of the Line" dans "Grand Theft Auto: San Andreas", les joueurs peuvent accomplir des missions secondaires, telles que l'achat de refuges et d'entreprises, et terminer diverses quêtes à collectionner. Il y a 18 ensembles de missions secondaires au total.
"Grand Theft Auto : San Andreas" propose une multitude de missions secondaires parallèlement au scénario principal. En tant que CJ, les joueurs peuvent acheter des maisons sur chaque île de la ville. Certaines de ces maisons comprennent Whitewood Estate, Rockshore West et Prickle Pine. Terminer "End of the Line" récompense les joueurs avec 25 000 $, qui peuvent servir d'acompte sur de nombreuses propriétés.
Les missions pour les objets de collection incluent la pulvérisation de 100 tags à travers Los Santos, la prise de 50 instantanés avec la caméra du jeu et la collecte de 50 huîtres.
Plusieurs entreprises de Los Santos proposent également des missions annexes, telles que l'auto-école, Ammu-Nation et la salle de sport.