Le jaguar n'a pas de prédateurs naturels, selon la Rainforest Alliance. Les humains sont la principale menace pour les jaguars, à travers le braconnage et la perte d'habitat naturel.
Les jaguars vivent dans de nombreux habitats différents, bien qu'ils se trouvent le plus souvent dans les jungles et les forêts. La perte des habitats naturels a conduit à une augmentation des contacts avec les humains, qui tuent des jaguars pour leurs fourrures, bien que cette pratique ne soit plus aussi courante qu'elle l'était autrefois. La Rainforest Alliance déclare qu'il ne reste plus qu'environ 15 000 jaguars dans la nature. Les jaguars chassent également certaines des mêmes espèces que les humains, ce qui augmente le danger de contact humain.