Le Jourdain se jette dans la mer Morte. Il coule vers le sud depuis la zone montagneuse où Israël, le Liban et la Syrie se rencontrent et traverse également la mer de Galilée.
Le Jourdain commence à l'intersection de quatre ruisseaux, le Banias, le Bareighit, le Hasbany et le Leddan, dans la partie supérieure de la plaine du lac Huleh. Si la rivière était mesurée en ligne droite, elle ne ferait pas plus de 136 milles de long.
Le Jourdain traverse également la mer de Tibériade et les eaux de Merom. Il mesure entre 45 et 180 pieds de large. Les rives du Jourdain débordent au printemps.