Les médecins du côlon peuvent être appelés gastro-entérologues. Ce sont des médecins spécialisés dans le diagnostic et la gestion des maladies du système digestif. Les médecins qui traitent uniquement les affections associées au côlon, au rectum et à l'anus sont appelés proctologues.
En plus de traiter les affections du côlon, un gastro-entérologue traite les affections de l'estomac, de l'œsophage, de l'intestin grêle et du système biliaire. Le gastro-entérologue est également un médecin de médecine interne, et les affections courantes du côlon observées comprennent le syndrome du côlon irritable, la diverticulite, la maladie de Crohn, les ulcères gastroduodénaux, le reflux acide et le cancer du côlon. Les gastro-entérologues éligibles peuvent devenir certifiés par l'American Board of Colon and Rectal Surgery. Les proctologues, bien que spécialisés dans le traitement du côlon, ne traitent pas les affections de l'estomac, du foie ou de l'œsophage comme le font les gastro-entérologues.