Rin se tue en se heurtant à la technique de foudre de Kakashi pour s'empêcher de nuire à son village dans le numéro 604 du manga japonais "Naruto". L'ennemi shinobi avait mis un monstre en elle et avait prévu de l'utiliser contre le village.
Le Ninja de Hidden Mist kidnappe Rin et lui met le Sanbi. Le Sanbi est un monstre à trois queues. Lorsque Rin revient au village, le Ninja de Hidden Mist avait prévu de libérer le monstre afin de détruire le village. Rin se tue pour empêcher que cela se produise. Kakashi a une technique magique spéciale qui fait apparaître des éclairs sur sa main. Rin se heurte à la main de Kakashi, lui faisant un trou dans la poitrine et la tuant. Elle le fait afin de sauver le village d'où elle vient, qui s'appelle Konoha, ou "Village caché dans les feuilles". Dans la première représentation de cette scène du manga, il semble que Kakashi tue Rin lui-même avec la technique. Cependant, la véritable situation est révélée plus tard. Obito, qui était amoureux de Rin, découvre sa mort trop tard pour la sauver. Il tue le ninja responsable du meurtre de Rin avec des pouvoirs qu'il venait d'acquérir.
